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Ecole thématique Eco-Evo-Epigen: Programme

Attention: merci de venir avec un ordinateur portable avec carte WiFi (pas de tablettes style iPad) pour profiter des TP/TD bioinfo.
Lundi 18/5                                                                                                                             
Matin

  • départ de l'autocar de la gare de La Rochelle Ville à 12h00

  • Arrivée des participants

  • 14h00 repas rapid

  • 14h30 présentation du centre

Après-midi

  • 15h00: Aspects historiques et épistémologiques de l’épigénétique Francesca Merlin (CR2, CNRS-IHPST), Antonine Nicoglou (PostDoc Labex “Who Am I?”, CRPMS & Institut Jacques Monod, IHPST), Conférence/débat

  • 17h00: Pause Café

  • 17h30: Présentation des participants, de leurs thématiques et de leurs attentes

Soir

  • 20h00: Présentation des participants, de leurs thématiques et de leurs attentes (suite)

Mardi 19/5                                                                                                                             
Matin

  • 9h00: Les bases épigénétiques de la plasticité et variabilité phénotypiques Stéphane Maury (Pr. Univ Orléans), Marie Mirouze (CR2, IRD), Cours interactif

  • 11h00: Pause Café

  • 11h30: Atelier sur l'épigénétique et plasticité et variabilité phénotypiques (partie 1): Ateliers par petits groupes (5 groupes max), un sujet pour chaque groupe, à préparer pour le jeudi matin

Après-midi

  • 14h00: Techniques d’épigénétique moléculaire: quels outils pour quelles questions et quelle espèce Stéphane Maury (Pr. Univ), Marie Mirouze (CR2, IRD), Clementine Vitte (CR1, CNRS), TD

  • 16h00: Pause Café et discussion par petits groupes avec les participants autour du réinvestissement de la journée sur leur sujet

  • 17h30: Présentations des solutions NGS par GATC

Soir

  • 20h00: Définition de l’épigénétique Frank Johannes (Pr. Univ of Groningen), Antonine Nicoglou (PostDoc Labex “Who Am I?”, CRPMS & Institut Jacques Monod, IHPST), table ronde

Mercredi 20/5                                                                                                                       
Matin

  • 9h00: Concepts et modèles de l’héritabilité Frank Johannes (Pr. Univ of Groningen), Etienne Danchin (DR CNRS), Cours interactif

  • 11h00: Pause Café - Poster Session

  • 11h30: Analyse et traitement des données (BS-Seq, Me-DIP, ChIP-Seq) Christoph Grunau (Pr. Univ), Clémentine Vitte (CR1, CNRS), TD/TPbioinfo

Après-midi

  • 14h00: Présentations des outils par Nimblegen/Roche via WebEx. La présentation portera sur les solutions de capture de séquences Nimblegen et en particulier sur les possibilités qu'offre le SeqCap Epi pour les analyses de méthylations.

  • 14h30: Analyse et traitement des données (BS-Seq, Me-DIP, ChIP-Seq) Christoph Grunau (Pr. Univ), Clémentine Vitte (CR1, CNRS), TD/TPbioinfo (suite)

  • 16h30: Pause Café - Poster Session

  • 19h00: Photo de groupe, Apéritif

Soir

  • 20h00: Vers une nouvelle conception de l’hérédité, implications évolutives Francesca Merlin (CR2, CNRS-IHPST), Etienne Danchin (DR CNRS), Arnaud Pocheville (PostDoc, University of Sydney), table ronde

Jeudi 21/5                                                                                                                              
Matin

  • 9h00: Rôle de l’épigénétique dans la structuration et l’évolution des génomes Marie Mirouze (CR2, IRD), Clémentine Vitte (CR1, CNRS), Cours  interactif

  • 10h30: Pause Café - Poster Session

  • 11h00: Atelier sur l'épigénétique et plasticité et variabilité phénotypiques (partie 2): travail en groupe

Après-midi

  • 14h00: Techniques spécifiques à l’analyse ADN répétées et  ARNs « non-codants » Cristina Vieira (Pr. Univ), Emmanuelle Lerat (CR1, CNRS), TD/TPbioinfo

  • 15h30: Pause Café - Poster Session

  • 16h00: Techniques spécifiques à l’analyse ADN répétées et  ARNs « non-codants » Cristina Vieira (Pr. Univ), Emmanuelle Lerat (CR1, CNRS), TD/TPbioinfo (suite)

  • 17h30: Atelier sur l'épigénétique et plasticité et variabilité phénotypiques (partie 3): travail en groupe

Soir

  • 20h00: Stratégie du RTP (publications, actions, ...), table ronde pour les membres du RTP

Vendredi 22/5                                                                                                                         
Matin

  • 9h30 Présentations des outils par Diagenode

  • 10h00 Pause Café

  • 10h30: Atelier sur l'épigénétique et plasticité et variabilité phénotypiques (partie 4): restitution par groupe en 10 min chacun

  • Bilan

Après-midi

  • 12h45 Départ de l'autocar pour La Rochelle

                                                                                                                                                   

Heures des repas: 7h00-9h00 Petit Déjeuner | 12h30 Déjeuner | 19h30 Diner

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