Lundi 28 novembre 2022

• 8h30 - 9h00 Accueil au laboratoire MycSA

• 9h00 - 12h30 Réalisation du protocole ATAC, avec une pause café-discussion dans la matinée. 12h30 -13h30 Déjeuner (plateaux-repas)

• 13h30 - 16h00 Réalisation des banques d’ATAC-seq

• 16h00 - pause café-discussion

• 16h30 – 19h30 fin des banques ATAC-seq et debriefing

Mardi 29 novembre 2022

• 8h15 - 8h30 Accueil au laboratoire MyCSA

• 8h30 - 10h30 Réalisation du protocole d’extraction des small RNAs

• 10h30 - 11h00 Café-discussion

• 11h00 - 12h30 Réalisation des banques de sRNA-seq

• 12h30 - 13h30 Déjeuner (plateaux-repas)

• 13h30 - 16h00 Réalisation des banques de sRNA-seq, suite

• 16h00 - 16h30 pause café-discussion

• 13h30 - 19h00 Réalisation des banques de sRNA-seq, suite, et debriefing

Mercredi 30 novembre 2022

• 9h00 - 9h15 Accueil à l’amphithéâtre Colette et Josy Bové (site INRAE de la Grande Ferrade)

• 9h15 - 10h30 Thomas Grentzinger : Trans-kingdom rapid and affordable Purification of RISCs (TraPR): easy access to functional smallRNA populations.

• 10h30 - 11h00 Café-discussion

• 11h00 - 11h45 Présentation d’Erwan Guichoux, Lab Manager de la Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux 

• 11h45 - 12h30 Présentation de la société Illumina

• 12h30 -14h00 Déjeuner (plateaux-repas)

• 14h00 – 15h00 Christoph Grunau - ATAC-seq on bulk cells of non-model organisms : critical experimental parameters and fundamentals of bioinformatics analysis

• 15h00 – 16h00 Ronaldo de Carvalho Augusto - scATAC-seq: single-cell chromatin accessibility from data acquisition to applications

• 16h00 – 16h30 Café-discussion

• 16h00 – 17h00 Fabrice Legeai - Premiers éléments d’analyse de données ATAC-seq & smRNA-seq

• 18h45 Départ en Bus pour le site de Château Couhins

• 19h15 – 22h00 Social Evening sur le site de Château Couhins

Jeudi 1er décembre 2022

• 8h30 – 9h00 Accueil dans la salle de formation informatique (site INRAE de la Grande Ferrade)

• 9h00 – 10h30 Analyses bioinformatiques de données ATAC-seq 10h30- 11h00 Café-discussion

• 11h-12h30 Analyses bioinformatiques de données ATAC-seq, suite

• 12h30 Fin de l’Ecole thématique